疾病管制署表示，近日國內各地降雨頻繁，南部地區誘卵桶陽性率亦逐漸上升，為降低登革熱、屈公病等蚊媒傳染病疫情風險，提醒民眾應加強落實社區容器減量及積水容器清理，並做好防蚊措施。另目前國內呼吸道感染通報件數雖處於低點，但近期已有校園傳出呼吸道群聚感染事件，再次籲請民眾做好勤洗手、有呼吸道症狀戴口罩及生病在家休息等良好個人衛生習慣，避免疫情於同儕間傳播。
疾管署監測資料顯示，國內今(2020)年截至目前累計55例登革熱病例(其中1例同時確診屈公病)，均為境外移入，個案感染地以東南亞國家為主。上週(6月7日至6月13日)台南市安南區、屏東縣萬丹鄉誘卵桶陽性率超過60%警戒值，另台南市仁德區、高雄市鳳山區、屏東縣屏東市陽性率達50%以上，亦接近警戒值；近兩週各地均有降雨，雨後易積水致病媒蚊孳生，籲請民眾應加強環境之巡、倒、清、刷；如有發燒、頭痛、出疹、後眼窩痛及關節痛等疑似症狀，應儘速就醫及告知旅遊活動史，以利及早通報、診斷及防治。
另上週新增1例漢他病毒出血熱病例，國內今年截至目前累計6例確診，較2016至2019年同期(分別為3、0、1、0例)為高；病例居住地分別為南部4例、北部2例；自2010年以來累計20例，以男性12例(佔60%)為多，年齡以40歲以上16例(佔80%)為多。再次提醒民眾落實「不讓鼠來、不讓鼠住、不讓鼠吃」措施，如發現鼠類排泄物時，應佩戴口罩、橡膠手套及打開門窗，並以稀釋漂白水(100cc市售漂白水+1公升清水)潑灑於可能被污染的環境，待消毒作用30分鐘後再清理。
此外，疾管署指出，雖然國內COVID-19(武漢肺炎)疫情風險低，但仍不可輕忽其他呼吸道傳染病的威脅，尤其學校、教托育機構等人際互動密切的場所，更易增加疫情傳播及群聚感染的風險，因此呼籲民眾應時常以肥皂正確洗手，隨時留意個人健康，有呼吸道症狀時應佩戴口罩；打噴嚏時請用面紙或手帕遮住口鼻，或用衣袖代替；與他人交談時，儘可能保持1公尺以上；若出現發燒、咳嗽等症狀，請戴上口罩儘速就近就醫，落實生病在家休息，避免疫情傳播。