依據疾管署監測資料顯示，第41週(10月6日至10月12日)門急診就診計15,666人次，較前一週(17,456人次)下降10.3%，惟可能受國慶日放假部分門診休診影響，尚須觀察；近期疫情呈持平波動趨勢，處流行期病例數仍多。近四週實驗室監測顯示腸病毒以克沙奇A16型為多，其次為克沙奇A6型；另其他克沙奇A型病毒及腸病毒D68型持續於社區活動，疫情傳播風險持續。鄰近國家/地區包括日本、中國及香港疫情呈上升趨勢，泰國疫情上下波動，新加坡及韓國疫情下降。其中日本近期病例數創下近十年同期新高，泰國及新加坡近期病例數亦高於去年同期。今(2024)年累計5例腸病毒感染併發重症確定病例，分別感染克沙奇A2型3例及克沙奇A10型2例，其中4例為未滿1歲幼童，籲請民眾留意孩童腸病毒重症前兆病徵。
疾管署提醒，腸病毒型別多元，目前除腸病毒A71型外，其他型別尚無疫苗可供預防，呼籲大人小孩皆應持續採行相關預防措施，包含保持良好的個人衛生習慣、注意居家及學習環境的通風及定期清潔消毒、時常清洗及消毒幼兒常接觸物品及玩具、避免接觸感染者、有疑似症狀儘速就醫、於流行期避免出入人多擁擠的公共場所等，才能防範社區內不同型別腸病毒之感染與侵襲。
疾管署再次強調，5歲以下嬰幼兒為腸病毒重症高危險群，且重症病程發展快速，家中嬰幼兒經醫師診斷感染腸病毒時，請注意觀察是否出現重症前兆病徵，如發現有嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力或麻痺、肌抽躍（無故驚嚇或突然間全身肌肉收縮）、持續嘔吐與呼吸急促或心跳加快等腸病毒重症前兆病徵，請儘速送到大醫院接受治療。疾管署已製作腸病毒防治相關影片、海報及單張等衛教資料，歡迎民眾至疾管署全球資訊網（https://www.cdc.gov.tw）下載運用及查詢相關資訊，或撥打免付費防疫專線1922（或0800-001922）洽詢。