疾管署進一步分析顯示，各行政區疫情升降趨勢不一致，以病例主要集中的10個流行熱區來說，估計本週永康區、南區、歸仁區為上升，安平區、仁德區、關廟區、安南區為下降，東區、北區、中西區則為持平。部分非流行熱區（如：佳里區、麻豆區、善化區、新營區、龍崎區等）病例數則有增加趨勢。防疫團隊除持續加強10熱區之孳生源清除、區塊化學防治、整頓高風險髒亂點，亦針對非流行熱區病例進行詳細疫調及積極防治介入，避免疫情於非流行熱區擴大。疾管署前進應變工作隊亦將於臺南持續運作，每日投入社區防疫工作，就近即時提供臺南市政府疫情分析、社區風險評估、策略建議及行政協調，直到疫情穩定下降至單週低於一千例之階段性目標後，同時協助臺南市準備後續銜接至滅孑保全計畫、由市府於11月至12月持續於熱區動員社區鄰里進行孳生源清除，避免疫情越冬。
疾管署說明，今(2023)年10月28日至11月3日期間，「登革熱前進應變工作隊」出動19組38人次，至北區、東區、南區、中西區、仁德區、歸仁區、關廟區、永康區、安南區、安平區、佳里區進行社區診斷及化學防治後成效評估，並巡檢中西區、安南區、東區教育部權管學校及中央權管場域。期間「登革熱前進應變工作隊」羅一鈞隊長亦參加中西區環境清潔日並訪視該區，針對部分易積水處所提出改善建議、巡查東區教育部權管校園及宿舍環境，提醒天溝及屋頂不易到達之處仍可能成為隱性孳生源，後至安南區視察內政部權管場域；另持續參加臺南市政府登革熱防治一級指揮中心會議，與市政府及相關專家密切合作，分析疫情趨勢及提供防治建議。
疾管署呼籲，疫情雖持續下降，但仍不可掉以輕心，民眾仍需持續共同配合各項防疫措施，請民眾持續落實「巡、倒、清、刷」並配合衛生單位防治措施，並留意身體狀況，進行戶外活動時，務必加強個人防護措施，穿著淺色長袖衣褲，使用政府機關核可含DEET、Picaridin或IR-3535等有效成分之防蚊藥劑，如出現發燒、頭痛、後眼窩痛、肌肉關節痛、出疹等疑似症狀，務必儘速就醫，並告知醫師旅遊史及活動史，亦請醫師落實詢問TOCC，適時使用登革熱NS1快篩試劑輔助診斷，及留意就診病患是否出現登革熱警示徵象，包括腹部疼痛及壓痛、持續性嘔吐、黏膜出血、嗜睡及躁動不安等，給予妥適醫療處置。另確診個案應持續落實防蚊，避免病毒擴散。